美國邁阿密大學羅森斯蒂爾海洋、大氣與地球科學學院的科學家開發(fā)出一種創(chuàng)新性生物信息工具BEREN,，利用高性能計算機，在海洋宏基因組數(shù)據(jù)集中識別出230種新型巨型病毒,，并對其功能進行了表征,。研究成果發(fā)表于最新一期《NPJ病毒》期刊上。

　　巨型病毒在單細胞海洋生物,，即原生生物的生存中發(fā)揮著重要作用,。原生生物包括藻類、變形蟲和鞭毛蟲等,，它們構成了海洋食物網(wǎng)的基礎,。由于這些原生生物是食物鏈的重要組成部分，因此,，一些大型DNA病毒往往會引發(fā)有害藻華暴發(fā)等危害,，影響人類健康。

　　此前,，因生物信息學流程局限,，巨型病毒長期未被充分檢測。此次,，團隊開發(fā)了一種名為BEREN（從環(huán)境宏基因組中恢復真核病毒的生物信息工具）的新工具,，能從龐大的公共DNA測序數(shù)據(jù)集中高效識別巨型病毒基因組。他們利用邁阿密大學的“飛馬座”超級計算機處理并組裝了大量宏基因組,，重建了數(shù)百個微生物群落數(shù)據(jù)集,。

　　團隊還發(fā)現(xiàn)，這些巨型病毒基因組中包含530種新功能性蛋白質,，其中9種參與光合作用,，表明其可能在感染過程中操縱宿主及其光合作用過程。

　　這項研究通過改進現(xiàn)有工具,，建立了檢測新型病毒的新框架,，未來有助于檢測水道中的污染物和病原體。（記者張佳欣）

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